重庆市药物种植研究所（中国医学科学院药用植物研究所重庆分所）位于世界自然遗产、国家级自然保护区、国家5A级风景名胜区——南川金佛山北麓。前身为建于1937年的金佛山垦殖社，1985年更名为“四川省中医药研究院药物种植研究所”，1997年重庆直辖后更名为“重庆市药物种植研究所”。 研究所隶属于重庆市科学技术局，是国内唯一成建制专业从事中药材种植研究的公益一类科研事业单位，长期从事药物种植、药用动植物资源、动植物野生变家种、病虫害防治、中药材标准化及开发研究。现有土地及森林面积3000余亩，建有我国最早的药用植物园和标本馆（馆藏蜡叶标本30余万份、生药标本5000余种）。

研究所编制人员150人，现有134人，其中高级专家和博士专业技术人员24人、获国务院政府特殊津贴专家2名、中国医学科学院神农学者1名（全国仅5名）、重庆市学术技术带头人1名、重庆市学术技术带头人后备人选1名、重庆市高级职称评审委员会专家2名、重庆英才青年拔尖人才1名、“西部之光”访问学者2名，以及四川农业大学、西南大学、重庆医科大学等高校校外硕士生导师7名。下设中药资源研究中心、中药材规范化生产研究中心、中药材生产质量控制研究中心、药用动物研究中心、药用菌研究中心、重庆市药用植物园、科技产业办公室、重庆市古树茶研究院、重庆市药用生物应用技术研究院8个业务科室（中心）和6个机关职能科室，以及1家科技成果转化公司（重庆市康泽科技开发有限责任公司）。建有特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室、金佛山森林生态系统重庆市野外科学观测研究站、重庆市道地药材规范化生产工程技术研究中心、重庆市中药良种选育与评价工程技术研究分中心等省部级科研平台4个，康泽众创空间、重庆市技术转移示范机构、道地药材专利导航分中心、重庆市陆生野生动物救护站等科技服务平台4个。建有1个国家中医药管理局重点学科（药用植物学）、3个市中医药重点学科（中药资源学、中药栽培学、药用动物学）、1个博士后科研工作站。是国家中医药重点学科药用植物学建设单位、国家中医药优势特色教育培训基地（中药）、国家中医药文化宣传教育基地、国家中医药优势学科中药资源学继续教育基地和国家健康旅游示范基地。

研究所累计开展各级各类科研项目850项，发表科研论文990篇，获得国家级成果奖4项（次）、省部级科技成果奖60项（次），拥有专利15项，其中发明专利6项；出版专著44部；发布植物新物种113个和多个新分布植物；拥有“南川天麻”、“南川大白及”2项地理标志证明商标；拥有天麻、黄精等200余种中药材种（养）殖及规范化生产成熟技术，在全国首创天麻野生变家栽（1978年获全国科学大会重大贡献奖）、活麝取香等技术；“南川天麻传统生产技艺”、“铁皮石斛酒制作工艺”2项技艺纳入重庆市市级非物质文化遗产项目名录。

近年来，研究所坚持认真学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想、党的十九大和十九届二中、三中、四中全会精神，全面落实习近平总书记对重庆提出的重要指示要求和党中央决策部署，积极营造良好的政治生态和创新创业氛围，抢抓成渝双城经济圈建设和大健康产业发展机遇。按照习近平总书记“传承精华、守正创新”的指示要求，充分发挥中医药特色优势大力开展科研创新和科技服务，积极投身决胜全面小康和决战脱贫攻坚事业，为全市实现“两高”“两地”目标和发挥“三个作用”贡献力量。